Методика уточненной типизации мтДНК для исследований гибридизации
большого (Spermophilus major Pall.) и желтого (S. fulvus Licht.) сусликов 

Сергей Витальевич Титов, доктор биологических наук, профессор, декан факультета физико- математических и естественных наук, заведующий кафедрой зоологии и экологии, Пензенский государственный университет (Россия, г. Пенза, ул. Красная, 40). svtitov@yandex.ru
Ольга Валерьевна Чернышова, аспирант, Пензенский государственный университет (Россия, г. Пенза, ул. Красная, 40). oliarabbit@yandex.ru
Максим Дмитриевич Симаков, инженер-исследователь лаборатории молекулярной экологии и систематики животных, Пензенский государственный  университет (Россия, г. Пенза, ул. Красная, 40). maksimakov@bk.ru
Антон Алексеевич Кузьмин, кандидат биологических наук, доцент кафедры биотехнологий и техносферной безопасности, Пензенский государственный технологический университет университет (Россия, г. Пенза, проезд Байдукова/ ул. Гагарина, 1а/11). kuzmin-puh@yandex.com

Актуальность и цели. Изучение гибридных популяций в пространстве и времени является актуальной задачей эволюционной биологии и популяционной экологии. Несмотря на довольно успешное изучение современных гибридных зон сусликов (Rodentia, Sciuridae, Spermophilus) в Поволжье, в процессе слежения за гибридными популяциями постоянно возникают вопросы по использованию для этого молекулярно-генетических маркеров. Целью исследования была разработка уточненной методики типирования мтДНК, позволяющей выявлять у особей большого и желтого сусликов, а также их гибридов специфический для Spermophilus fulvus и интрогрессивный привносимый S. major гаплотип А. Материалы и методы. Генетический материал для работы был сформирован из коллекции образцов ДНК кафедры «Зоология и экология» ПГУ. Аналитическая выборка составила 13 образцов ДНК S. fulvus и
18 образцов S. major, полученных от сусликов, отловленных в зоне контакта. При разработке метода уточненной типизации гаплотипа «А» мтДНК были использованы полученные при секвенировании нуклеотидные последовательности контрольного региона (D-loop) (1007 пн) большого суслика (n = 9) и желтого суслика (n = 4). Результаты. Анализ нуклеотидных последовательностей фрагмента гаплотипа «А» мтДНК (от 337 до 692 пн, 355 пн) двух видоспецифических образцов выявил только две области с сайтами узнавания эндонуклеазы рестрикции Fat I, по которым возможно их идентифицировать. При этом для образца S. major ожидается получение трех фрагментов рестрикции (94, 102 и 159 пн), а для образца S. fulvus – двух фрагментов (102 и 253 пн). Выводы. Нуклеотидный анализ имеющихся в базе секвенсов гаплотипа «А» мтДНК сусликов показал правильность выделения видоспецифических признаков уточненной типизации этого гаплотипа мтДНК у S. major и S. fulvus.

Ключевые слова

большой суслик, желтый суслик, межвидовая гибридизация, митохондриальная ДНК, контрольный регион, рестрикционный анализ

 Скачать статью в формате PDF

Для цитирования:

Титов С. В., Чернышова О. В., Симаков М. Д., Кузьмин А. А. Методика уточненной типизации мтДНК для исследований гибридизации большого (Spermophilus major Pall.) и желтого (S. fulvus Licht.) сусликов // Известия высших учебных заведений. Поволжский регион. Естественные науки. 2022. № 3. С. 65–73.
doi:10.21685/2307-9150-2022-3-6